Единственный в России и странах СНГ профильный научно-исследовательский институт. Цель его организации — проведение клинических и фундаментальных научных исследований в области реконструктивной и пластической микрохирургии, тканевой инженерии для улучшения качества жизни граждан, получивших травму, страдающих хроническим заболеванием, либо пороком развития.
Организатором первого в России Института микрохирургии стал Заслуженный врач РФ, профессор Владимир Федорович Байтингер.
Институт был основан 6 февраля 2002 года и зарегистрирован Томской регистрационной палатой за № 28393/15855 как Автономная некоммерческая организация «Научно — исследовательский институт микрохирургии Томского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук».
Институт создавался под патронажем Губернатора Томской области В. М. Кресса и Института микрохирургии B.O’Brien (Мельбурн) и его нынешнего директора, профессора Вайна Моррисона (Wayne Morrison). В структуре Института имеется две научные лаборатории (экспериментальной микрохирургии, гемодинамики конечностей), клиника на 25 коек (работа в режиме круглосуточной экстренной помощи пациентам с травмой дистальных отделов конечностей, а также плановой помощи по ликвидации обширных дефектов мягких тканей, костей, суставов) — 1200–1300 операций в год. Амбулаторно-поликлиническая служба (8000 посещений в год) оказывает реабилитационную помощь пациентам, получившим травму кисти, а также осуществляет программу для больных сахарным диабетом (профилактика развития диабетической стопы).